Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test

Agua residual sin tratar que no ha sido químicamente tratado.

La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua es una prueba de reacción en cadena cuantitativa de la polimerasa de transcripción inversa (RT-qPCR) que detecta y cuantifica el ARN viral en una muestra concentrada de agua residual adecuadamente preparada.

Cuando se utiliza con el protocolo de concentración de 105 ml, la concentración más baja de SARS-CoV-2 en aguas residuales que se puede detectar con la prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua es de aproximadamente 1 copia de gen/1 ml.

Al usarse con el procedimiento de extremo a extremo de IDEXX, la prueba de IDEXX se ha validado para proporcionar una recuperación altamente coherente de SARS-CoV-2 en aguas residuales.

El protocolo validado por IDEXX concentra el virus SARS-CoV-2 a partir de 105 ml de agua residual. El personal de laboratorio puede analizar mayores o menores volúmenes de agua, realizando el procedimiento básico adaptado para diferentes volúmenes de entrada con los equipos de centrifugación adecuados.

La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua analiza 5 µL de ARN extraído, preparado a partir de una muestra concentrada de agua residual, aunque recomendamos tener un volumen adicional a mano para compensar las pérdidas durante el pipeteo y las muestras duplicadas.

IDEXX proporciona un ejemplo de protocolo de concentración basado en la centrifugación y la precipitación con polietilenglicol (PEG) que se ha validado para proporcionar resultados coherentes. Este protocolo se puede modificar para cumplir con las necesidades específicas de su laboratorio. También se pueden usar otros métodos de concentración, como la ultrafiltración, la filtración a través de membranas, etc., y los clientes han usado con éxito estos métodos de concentración con reactivos de IDEXX. Estos han de validarse para verificar el rendimiento.

El mantenimiento de las muestras a bajas temperaturas ayuda a prevenir la degradación de las muestras y a asegurar la precipitación eficiente del virus SARS-CoV-2.

La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua ha sido validada para el uso con el IDEXX Water DNA/RNA Magnetic Bead Kit para la extracción de ácidos nucleicos, incluido ARN de SARS-CoV-2, a partir de concentrado de agua residual. También se pueden usar otros kits de extracción con la prueba; los clientes han empleado con éxito otros kits con los reactivos RT-qPCR de IDEXX.

Las aguas residuales son una matriz extremadamente compleja, y la vigilancia de las aguas residuales requiere materiales de control exhaustivos. Consulte el informe Complete IDEXX Wastewater Surveillance Procedure con el fin de obtener una descripción completa del procedimiento de extremo a extremo y los controles requeridos y recomendados.

Consulte los prospectos del producto para ver las condiciones de almacenamiento recomendadas al momento de recibir el producto y después de la reconstitución / primer uso.

Los Centros de Control y Prevención de Enfermedades (CDC) de Estados Unidos indican que se puede usar un laboratorio con nivel de bioseguridad 2 (BSL-2) con precauciones adicionales para el análisis de muestras ambientales, incluidos la manipulación y el procesamiento de muestras de agua residual asociados al SARS-CoV-2. Se dispone de orientación específica en los CDC de EE. UU.: Directrices interinas de bioseguridad de laboratorio para la manipulación y el procesamiento de especímenes asociados con la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19).⁴

Consulte a sus autoridades sanitarias locales para obtener recomendaciones específicas.

Siga los procedimientos recomendados por las autoridades sanitarias locales para la manipulación y el procesamiento de muestras de agua residual asociadas con SARS-CoV-2. Los CDC de EE. UU. publican una fuente de información: Directrices interinas de bioseguridad de laboratorio para la manipulación y el procesamiento de especímenes asociados con la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19).⁴

Siga todas las directrices normativas y de seguridad locales. 

Se puede usar un proceso opcional de tratamiento con calor para inactivar las muestras durante la pasteurización. Consulte el prospecto del producto para ver un ejemplo. 

La fase de pasteurización puede reducir la detección de ARN de SARS-CoV-2. Contacte al representante de IDEXX para obtener información adicional.

Deseche todas las muestras y materiales de conformidad con las directrices normativas locales.

La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua no está autorizada por la EPA de EE. UU. para la detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales. La EPA de EE. UU. actualmente no regula las pruebas de detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales ni aprueba los métodos de prueba para este fin. Las pruebas de detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales podrían estar reguladas o no por sus autoridades locales o municipales. Compruebe la existencia de regulaciones que podrían aplicarse en su área.

Sí, la prueba RT-PCR de SARS-CoV-2 en agua es compatible con —o incluye— todos los controles y procesos recomendados por el CDC para el envío de datos al NWSS. Consulte el informe Complete IDEXX Wastewater Surveillance Procedure con el fin de obtener una descripción completa del procedimiento de extremo a extremo, que incluye todos los controles requeridos y recomendados.